消化系疾病国家临床医学研究中心以“胃癌的早期诊断及精准治疗”、“难治性肠病的内外科治疗”、“晚期肝病的综合诊治”、“内镜介入新技术”为重点突破方向，共组织6个研究组。中心核心单位及协作单位依据各自临床研究资源及研究力量的基本情况，选择重点参与的研究课题。借中心成立大会召开的契机，各研究组就研究任务分配、组织模式、资源整合等进行了专题讨论，形成了后续研究工作开展的具体方案。

        为有效解决我国临床医学研究投入相对薄弱、国际顶尖医学研究成果相对匮乏等痼疾，科技部等8部门共同制定了《医学科技发展“十二五”规划》，旨在通过建立一批跨地域、多学科联合的临床医学研究转化网络，逐渐摸索并最终构建适合我国国情的医学研究与转化平台。国家临床医学研究中心是促进我国医学科技创新体系优化重构的重大举措，是提升我国生物医药科技产业国际竞争力的重要内容，更是整合临床医学研究资源和研究力量的重要依托。

        2014年6月，西京消化病医院以第一名获批消化系疾病国家临床医学研究中心，是我国西部唯一的国家级临床医学研究中心。消化系疾病国家临床医学研究中心获批后，依托学科影响力，在全国范围内成立整合中心，目前已构建覆盖27省市100余家医院的三级平台网络体系。通过中心网络的建设及研究任务的推荐，有望在胃癌、肠病、肝病、内镜介入等方面形成具有我国特色的成果、医疗产品及技术优势，将极大的推动我国消化系疾病研究的发展，提升我国生物医药科技产业的竞争力，为我国临床医学未来组织模式的改革与优化提供可资借鉴的建设经验。